Fais connaissance avec le Dr Roman Bauer, l'un des développeurs de la plateforme innovante BioDynaMo.
Du 21 au 23 octobre 2022, des intervenants de renommée mondiale, des scientifiques, des chercheurs, des écrivains et des cryogénistes se réuniront à Rafz, en Suisse, pour la conférence Biostasis2022. L'un de nos intervenants les plus attendus sera le Dr Roman Bauer. Roman Bauer, Ph.D., est un biologiste informatique et maître de conférences au département d'informatique de l'université du Surrey, au Royaume-Uni. Il est surtout connu pour son rôle dans le développement de BioDynaMo, un logiciel de calcul qui permet de modéliser et d'analyser la dynamique des tissus biologiques. Cela a conduit le Dr Bauer dans le domaine de la cryooréservation computationnelle, qui traite de l'analyse des protocoles de biostase dans le but de générer des processus de cryooréservation optimaux pour les cellules, les tissus et les organes.
Le Dr Roman Bauer possède une solide expérience en informatique et en neuro-informatique. Il a obtenu sa licence et sa maîtrise en sciences et ingénierie informatiques à l'ETH Zurich, en Suisse. Il a ensuite effectué ses études doctorales à l'Institut de neuro-informatique (INI) de l'ETH Zurich et de l'Université de Zurich. Pendant cette période, il s'est principalement concentré sur les simulations du développement cortical. Il a poursuivi sa formation en devenant associé de recherche postdoctoral à l'université de Newcastle, puis a mené son projet de bourse MRC et EPSRC en tant que chercheur principal indépendant. Le Dr Bauer est titulaire d'un doctorat en neurosciences computationnelles. Il est chargé de cours et dirige une équipe de recherche interdisciplinaire en biologie computationnelle à l'université du Surrey, au Royaume-Uni.
La biologie computationnelle couvre un éventail de rôles et est considérée comme une science interdisciplinaire. Elle implique l'analyse et le développement de données, l'analyse statistique, la bioinformation, etc. Bien que cela puisse sembler écrasant, la passion et la solide expérience du Dr Bauer sont ce qui l'a amené à consacrer sa carrière à l'avancement de la modélisation informatique en biologie expérimentale.
Pendant son séjour en tant qu'associé de recherche à l'université de Newcastle, le Dr Bauer a lancé une idée de modélisateur de dynamique de la biologie en open-source à l'Organisation européenne pour la recherche nucléaire (CERN). Celle-ci a accepté et BioDynaMo a été lancé en 2018. Logiciel accessible gratuitement, la plateforme BioDynaMo permet aux experts en informatique et aux non-experts de créer, d'exécuter et de visualiser des simulations biologiques 3D à base d'agents depuis un simple ordinateur portable[1]. BioDynaMo peut stimuler des millions de neurones à l'aide d'un ordinateur portable. Cela favorise à la fois les applications de recherche et la reproductibilité au sein de la communauté scientifique.
Le Dr Bauer s'est intéressé à la cryogénisation après la mort d'un de ses amis proches. La mortalité de son ami, malgré son mode de vie sain, lui a fait regarder la vie un peu différemment. Il a commencé à penser qu'il serait agréable de pouvoir interrompre le processus de la mort, réduisant ainsi la douleur physique et mentale des proches. Il s'est ensuite intéressé à la science sous-jacente de la cryopréservation. Au départ, il s'agissait d'une pure curiosité, mais il a fini par réaliser que ses méthodes de calcul des applications biomédicales pouvaient également être appliquées à la cryopréservation.
La cryopréservation computationnelle implique l'utilisation de modèles logiciels pour analyser différentes méthodes de protocoles de cryopréservation. L'un des objectifs du Dr Bauer est de disposer d'un outil informatique qui pourrait être utilisé conjointement avec le travail expérimental pour générer des processus de cryopréservation personnalisés et optimaux pour les cellules, les tissus et les organes. L'une des faiblesses scientifiques les plus importantes de la cryogénisastion est l'incapacité à démontrer la réussite de la préservation du cerveau après la réanimation [1]. C'est l'une des raisons pour lesquelles les recherches les plus récentes du Dr Bauer se concentrent sur la cryopréservation des tissus neuraux.
BioDynaMo et la recherche en cours du Dr Roman Bauer ont le potentiel de transformer la façon dont la cryoprotection est faite. Ceci, à son tour, pourrait entraîner de meilleurs résultats pour les futures réanimation, plus de crédibilité dans le domaine, et une communauté cryogénique croissante. Tu peux lire son profil complet de chercheur dans la publication en ligne d'Alcor, Cryonics.
Le Dr Roman Bauer était un intervenant invité à la conférence Biostasis2021 et à la conférence originale Biostasis2020. Il reviendra pour parler à la conférence Biostasis2022 à Rafz. Lors de sa conférence de 2021, le Dr Bauer a parlé de l'avenir de la cryopréservation en utilisant des approches informatiques et l'automatisation. Il a expliqué comment les outils mathématiques et informatiques ont le potentiel d'optimiser les protocoles de cryopréservation et d'autres applications biomédicales, notamment en ce qui concerne les tissus neuronaux. Le Dr Bauer nous a également donné de plus amples informations sur sa plateforme logicielle BioDynaMo. Tu peux écouter l'intégralité de son intervention ci-dessous.
Quel aspect de la biostase vous a fait dire "Je veux travailler dans ce domaine" ?
Je pense que la conservation à long terme d'organes et du corps entier est une possibilité réelle de notre vivant. Si cette possibilité se concrétise, il s'agira de l'avancée biomédicale la plus importante, avec des implications à de nombreux niveaux différents. Cette perspective a été une raison majeure de ma passion pour la biostase.
Au cours de toutes vos années de recherche sur la cryogénisation, quelle est la réalisation dont vous êtes le plus fier ?
Avec mon étudiant en doctorat, Jack Jennings, et mon postdoc, le Dr Sanja Bojic, nous avons inventé une nouvelle méthode pour améliorer la cryopréservation en utilisant la modélisation informatique. Nous avons confirmé nos prédictions de manière expérimentale, bouclant ainsi la boucle entre la théorie et la pratique.
Si vous pouviez obtenir la solution parfaite à l'un des défis actuels liés à la cryopréservation en appuyant sur un bouton, laquelle choisiriez-vous et pourquoi ?
J'aimerais savoir comment le microcircuit neural des mammifères peut être protégé des cristaux de glace et de la toxicité.
Quel est le projet le plus intéressant sur lequel vous travaillez en ce moment ?
Nous sommes actuellement dans les dernières étapes de la mise en œuvre d'un nouveau logiciel informatique permettant de simuler la cryopréservation et la décongélation des cellules et des tissus de manière très détaillée (à l'aide d'un modèle dit "à base d'agents"). Il permet de formuler, de comparer et de tester des hypothèses et constitue donc un outil puissant pour la recherche sur la cryopréservation.
Qu'attendez-vous le plus de la conférence Biostasis2022 ?
Rencontrer des personnes partageant les mêmes idées et en connaître de nouvelles. Et c'est une excellente occasion de contribuer au développement de la communauté.
Qu'est-ce qui vous donne confiance dans le travail de Tomorrow Bio ?
Tomorrow Bio fait preuve de professionnalisme et de concentration. Les fondateurs ont un esprit scientifique et peuvent se targuer de plusieurs réalisations impressionnantes.
Le Dr Roman Bauer est un membre visionnaire de l'industrie de la biostase. Grâce à son rôle dans le développement de BioDynaMo, les scientifiques et les chercheurs sont en mesure d'utiliser la biologie computationnelle pour la cryogénisation. En fin de compte, cela a le potentiel de révolutionner la recherche en cryogénisation et de tester les meilleures pratiques en matière de cryopréservation. Si tu souhaites entendre les dernières nouvelles de cette année de la part du Dr Bauer à Biostasis2022, achète ton billet aujourd'hui. Tu trouveras plus de détails sur l'événement et sur la façon de réserver ta place sur le site Web ici. Nous nous réjouissons de t'y voir ! D'ici là, n'hésite pas à commencer à nouer des contacts en allant sur notre Discord.
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